Instalaciones & Recursos
El laboratorio del Dr. Burchard es una instalación moderna de 279 metros cuadrados localizada en el Campus de Mission Bay de la Universidad de California en San Francisco. Éste pertenece al Centro de Biología del Pulmón de la Facultad de Medicina, situado en edificio Rock Hall. El campus UCSF Mission Bay se inauguró en 2003 y desde entonces ha evolucionado continuamente para convertirse en un campus de investigación dinámico que acoge el nuevo centro médico de la UCSF, inaugurado en 2015. Éste cuenta con 80.733 metros cuadrados destinados a un hospital centrado en la atención de niños, mujeres y pacientes con cáncer y se localiza adyacente a los edificios e instalaciones de investigación de la UCSF.
El laboratorio del Dr. Burchard totalmente operacional para:
- Detección de nuevos polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs)
- Procesamiento de ADN y almacenamiento
- Genotipado de alto rendimiento
- Secuenciación de nueva generación
- Realización de pruebas inmunodiagnósticas
- Reclutamiento clínico
- Análisis genético estadístico
- Bioinformática
- Computación de alto rendimiento
Recursos genéticos desarrollados por el laboratorio
El laboratorio del Dr. Burchard ha constituido el mayor estudio de asma en niños pertenecientes a minorías étnicas de todo Estados Unidos (número total de muestras = 9.744). Hemos reunido datos de factores sociales, ambientales y biológicos que resultan de riesgo para el asma, así como información detallada de la historia clínica y la respuesta al tratamiento. Nos orgullecemos por ser “una tienda multiservicios,” ya que somos capaces de reclutar a nuestros pacientes y generar y analizar los datos genéticos.
Biobanco de asma
Hemos establecido el Biobanco de Asma para facilitar la investigación genética en asma y proporcionar acceso abierto a la base de datos y muestras biológicas con cierto coste para aquellos proyectos de colaboración que sean interesantes. Además, nosotros somos capaces de proporcionar ayuda en el uso de los datos almacenados en el banco, incluyendo ayuda en el análisis estadístico.
Pruebas genéticas y análisis
Nuestro laboratorio también ofrece la posibilidad de colaborar con investigadores que necesiten un análisis completo, desde las pruebas genéticas hasta los análisis computacionales. En concreto, nosotros analizamos genes candidatos prometedores identificados por investigadores usando material biológico (ADN y plasma) a partir de una gran colección de muestras bien caracterizadas clínicamente, ya sea procedentes de estudios en familias o en estudios de caso control de asma en individuos de raza/etnia diversa.
Acceso a otros servicios
A través del Instituto de Genética Humana de la UCSF, los miembros del laboratorio del Dr. Burchard tienen acceso al Servicio de Genómica (Genomics Core Facilities [GCF]). El GCF se especializa en PCR en tiempo real a media y gran escala, determinación de SNPs, epigenética y secuenciación, empleando las técnicas más avanzadas disponibles en la actualidad.
Los miembros del laboratorio del Dr. Burchard tienen también acceso al Servicio de Biomarcadores del Tabaco (Tobacco Biomarkers Core Facility) localizado en el centro del cáncer Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center. Este servicio permite la realización de análisis químicos para el control del tabaco y para la comunidad de investigación del cáncer y ha realizado el análisis de muestras biológicas para estudios de investigación de farmacología del tabaco y toxicología durante más de 30 años. Tiene la capacidad de examinar gran número de muestras, normalmente analiza unas 10.000 muestras al año.
Recursos computacionales internos
El laboratorio del Dr. Burchard lleva a cabo todos los análisis bioinformáticos y estadísticos usando servidores locales y clusters de computación de alto rendimiento compartidos basados en el sistema Linux.
